Roche cobas s 201 system Manual de usuario

Tipo
Manual de usuario
02/2007, versión 1.0 1.1
Algoritmos de
pooling 1
Información general
El sistema cobas s 201 puede configurarse para crear pooles grandes. Los
pooles grandes contienen alícuotas iguales procedentes de las muestras de
donantes n.
n es igual a 24, 48 ó 96.
Los pooles de gran tamaño se utilizan únicamente para las
pruebas MPX.
Primary Pooling
El proceso de Primary Pooling para pooles grandes consta de dos pasos:
1 Plate Run – Pool n (MPX): los pooles provisionales con alícuotas
procedentes de 12 muestras de donantes se crean en los pocillos de la placa
intermedia. En la configuración predeterminada, el sistema cobas s 201
prepara una seroteca para guardar una alícuota procedente de cada tubo
de donante, por si se necesitara en un análisis secundario.
2 Batch Run – Pool n (MPX): se pipetean los controles y, a continuación, se
combinan alícuotas iguales procedentes de los pocillos de la placa
intermedia en tubos S, para crear pooles con 24 (dos pocillos), 48 (cuatro
pocillos) o 96 (ocho pocillos) muestras.
Secondary Pooling
Si los resultados de la prueba en un Primary Pool de gran volumen no son
válidos o son reactivos, será necesario realizar seguidamente un análisis
(secundario). La modalidad Secondary Pooling incluye las siguientes
opciones:
Repeat Batch Run – Pool n (MPX): el paso 2 de la serie analítica
Primary Pooling se repite para volver a analizar las muestras de
donantes con resultados no válidos.
Two-dimensional (2D) Pooling (MPX): consiste en crear una
matriz de pooles de donantes, en la que se pipetea cada muestra de
donante en un grupo único formado por dos pooles separados de
modo que, si dos pooles son reactivos, los resultados podrán
atribuirse a una determinada muestra de donante.
1.2 02/2007, versión 1.0
Confirmation Pooling (MPX): consiste en crear pooles de una sola
muestra para confirmar si las muestras de donantes sospechosas
son reactivas. Las muestras restantes se agrupan en pooles de
cuatro, seis, once o doce muestras para confirmar que los
resultados de la prueba no son reactivos.
Resolution Pooling (MPX): consiste en preparar los pooles de una
sola muestra para analizar individualmente muestras de pooles no
válidos o reactivos.
Algoritmos de pooling
02/2007, versión 1.0 1.3
Ruta del flujo de trabajo
A continuación, se muestra la ruta del flujo de trabajo predeterminada
para analizar las muestras en pooles de gran tamaño (ilustración 1.1).
Ilustración 1.1
Ruta del flujo de trabajo para pooles de gran tamaño
Resolution
Pooling
Error
No reactivo
Reactivo
OK
Otros
Resultado
Estado del
pipeteo
Pool escaso
No
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de batch)
Repeat Batch
Run
Confirmation
Pooling
Completado,
no reactivo
OK
Aspirado
Error
Estado del
pipeteo
No
2D Pooling
No reactivo
No válido
Batch no válido
Completado,
no reactivo
No reactivo
Resultado
Completado,
no reactivo
Evaluacn
matriz 2D
No válido
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de placas)
No reactivo
No válido
Completado,
no reactivo
Completado,
reactivo
Completado,
reactivo
Reactivo
Reactivo
Resultado
Tam añ o
del pool
Igual a 1
Excluye los donantes
con prueba positiva
externa
Superior a 1
1.4 02/2007, versión 1.0
El sistema se encarga de asignar las rutas de la ilustración 1.1. El
administrador del laboratorio puede cambiar la ruta del flujo de
trabajo predeterminada y utilizar, por ejemplo, un Resolution
Pooling para volver a analizar las muestras procedentes de pooles
reactivos o no válidos (consulte el apartado Cambiar la petición de
pooling en el Manual de referencia de hardware y software del sistema
cobas s 201).
Serie analítica de placas
La serie analítica de placas es el primer paso de un proceso de Primary
Pooling. Las muestras que se pipetean correctamente en la placa intermedia
durante la serie analítica de placas se programan para una serie analítica de
batch, que es el segundo paso de un proceso de Primary Pooling.
Si se han aspirado correctamente, las muestras con errores de pipeteo se
programan para la modalidad Resolution Pooling (página 1.11). De lo
contrario, podrán incluirse en otra serie analítica de placas (ilustración 1.2).
Ilustración 1.2
Serie analítica de las placas
Resolution
Pooling
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de placas)
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de batch)
No
Aspirado
Error
OK
Estado del
pipeteo
Algoritmos de pooling
02/2007, versión 1.0 1.5
Serie analítica de batch
La serie analítica de batch es el segundo paso de un proceso de Primary
Pooling. Las muestras que se pipetean correctamente en un pool de gran
tamaño durante la serie analítica de batch se analizan para detectar la
presencia de los analitos buscados (ilustración 1.3).
Las muestras de donantes del pool se clasifican como no-reactivas
cuando el pool es no reactivo.
Si el pool es reactivo y contiene las 96, 48 ó 24 muestras previstas,
las muestras de donantes del pool se programan para la modalidad
2D Pooling (consulte la página 1.6).
Si el pool es reactivo pero contiene menos de las 96, 48 ó 24
muestras previstas (a causa de errores de pipeteo), las muestras de
donantes del pool escaso se programan para la modalidad
Confirmation Pooling (consulte la página 1.10).
Si el resultado de la prueba no es válido, se programará otra serie
analítica de batch (Repeat Batch Run).
Las muestras con errores de pipeteo se incluirán en un Resolution Pooling.
Ilustración 1.3
Serie analítica de batch
Resolution
Pooling
Error
No reactivo
Reactivo
OK
No válido
Resultado
Estado del
pipeteo
Pool escaso
No
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de batch)
2D Pooling
Repeat
Batch Run
Confirmation
Pooling
Completo, no
reactivo
1.6 02/2007, versión 1.0
2D Pooling
Si el resultado un Primary Pool o Repeat Batch Pool es reactivo y el pool
contiene todo el complemento (24, 48 ó 96) de las muestras de donantes,
se programará la modalidad 2D Pooling.
El administrador del laboratorio puede utilizar la modalidad
2D Pooling en vez de una Repeat Batch Run para volver a analizar
un Primary Pool no válido.
La modalidad 2D Pooling crea una matriz de pooles de muestras, en la que
cada muestra de donante del pool original se pipetea en un grupo único
formado por dos pooles separados. Los resultados de los dos pooles se
evalúan para determinar si la muestra de donante es no reactiva o si es
preciso realizar un Resolution Pooling (ilustración 1.4).
Evaluación de la matriz 2D
El número de pooles de la matriz 2D depende del tamaño del Primary
Pool inicial:
Ilustración 1.4
2D Pooling
2D Pooling
Batch no válido
Evaluación
matriz 2D
Resolution
Pooling
Completado,
no reactivo
No reactivo
Otros
Tamaño del
Primary Pool
Número de pooles en 2D MxN
24 4 pooles de 6 muestras
6 pooles de 4 muestras
4x6
48 8 pooles de 6 muestras
6 pooles de 8 muestras
8x6
96 Dos batches que contienen
cada uno:
8 pooles de 6 muestras
6 pooles de 8 muestras
8x6
(dos matrices)
Algoritmos de pooling
02/2007, versión 1.0 1.7
La ilustración 1.5 muestra una matriz de 4 x 6. Los resultados del pool se
muestran fuera de la matriz. Los resultados de donantes (dentro de la
matriz) se interpretan en base a los resultados de los dos pooles en los que
se analizó la muestra de donante.
Una muestra de donante analizada en dos pooles no reactivos (-,-) puede
obtener el resultado Completo, no-reactivo (ilustración 1.5).
Si los resultados analíticos de todos los pooles en 2D son no válidos debido
a un error en los controles del batch, se programará la modalidad Repeat
2D Pool (ilustración 1.6).
El sistema sólo admite un Repeat 2D Pool si los resultados
analíticos de TODOS los pooles en 2D son no válidos.
Ilustración 1.5
Todos los pooles no reactivos
Resultados del pool
Todas las muestras de
donantes obtienen el
resultado Completo,
no reactivo
Ilustración 1.6
Todos los pooles no válidos
1.8 02/2007, versión 1.0
Las muestras de donantes se analizarán en dos pooles reactivos (+,+)
dentro de la modalidad Resolution Pooling para confirmar si el resultado
es reactivo. Las muestras incluidas en un pool con esa muestra y con
resultado no reactivo en otro pool [(+,-) o (-,+)], pueden clasificarse
como completadas, no-reactivas (ilustración 1.7).
Si sólo hay un pool con resultado reactivo, no existirá ninguna
intersección para identificar la muestra reactiva. En ese caso todas las
muestras en el pool reactivo se programan para la modalidad Resolution
Pooling (ilustración 1.8).
Ilustración 1.7
La intersección reactiva identifica la muestra reactiva
Muestra programada
para un Resolution
Pooling
Ilustración 1.8
Sin intersección reactiva
Cuatro muestras
programadas para un
Resolution Pooling
Algoritmos de pooling
02/2007, versión 1.0 1.9
El sistema programa una muestra de donante analizada en dos pooles no
válidos (-,-) para un Resolution Pooling. Las muestras incluidas en un pool
con esa muestra y con resultado no reactivo en otro pool [(I,-) o (-,I)],
pueden clasificarse como completadas, no-reactivas (ilustración 1.9).
Si sólo hay un pool con resultado no válido, no existirá ninguna
intersección para identificar la muestra no válida. En ese caso todas las
muestras en el pool no válido se programan para la modalidad Resolution
Pooling (ilustración 1.10).
Ilustración 1.9
La intersección no válida identifica la muestra reactiva
Muestra programada para un
Resolution Pooling
Ilustración 1.10
Sin intersección reactiva
Seis muestras programadas
para un Resolution Pooling
1.10 02/2007, versión 1.0
Confirmation Pooling
Cuando un Primary Pool reactivo contiene menos muestras de las
previstas a causa de errores de pipeteo, el sistema programará un
Confirmation Pooling en vez de un 2D Pooling.
Asimismo, el administrador del laboratorio puede utilizar un
Confirmation Pooling en vez de un 2D Pooling. No obstante, una
vez que se haya iniciado la modalidad 2D Pooling, será preciso
seguir el algoritmo de pooling 2D hasta el final.
La modalidad Confirmation Pooling permite analizar algunas muestras
individualmente (p. ej., para confirmar los resultados serológicos positivos).
Las muestras de donantes potencialmente reactivas se identifican antes de
que se inicie el Confirmation Pooling (consulte la pestaña Exclude Donors en
el Manual de referencia de hardware y software del sistema cobas s 201).
Estas muestras se pipetean en pooles de una sola muestra. Las muestras
restantes se pipetean en pooles pequeños. Todos los pooles se analizan para
detectar los analitos buscados (ilustración 1.11).
La muestra del donante se clasifica como no reactiva cuando un
pool de una sola muestra es no reactivo.
Las muestras de donantes del pool se clasifican como no-reactivas
cuando un pool con varias muestras es no reactivo.
La muestra del donante se clasifica como reactiva cuando un pool
de una sola muestra es reactivo.
Todas las muestras de donantes del pool se programan para la
modalidad Resolution Pooling (consulte la página 1.11) cuando un
pool con varias muestras es reactivo.
Si el resultado de la prueba no es válido, podrá repetirse un
Confirmation Pooling.
Ilustración 1.11
Confirmation Pooling
Resolution
Pooling
Confirmation
Pooling
Completado,
no reactivo
No reactivo
Resultado
Completado,
reactivo
Reactivo
Tamaño del
pool
Igual a 1
Excluye los donantes
con prueba positiva
externa
Superior a 1
No válido
Algoritmos de pooling
02/2007, versión 1.0 1.11
Resolution Pooling
Para las muestras con errores de pipeteo durante la serie analítica Primary
Pooling y muestras de un Confirmation Pool reactivo o 2D Pool reactivo,
se programa la modalidad Resolution Pooling. Cada Resolution Pool
contiene una parte alícuota de una muestra de un donante individual.
Asimismo, el administrador del laboratorio puede utilizar un
Resolution Pooling para solucionar resultados no válidos o
reactivos.
Los Resolution Pools se analizan para detectar los analitos buscados
(ilustración 1.12).
La muestra del donante se clasifica como no reactiva cuando el
Resolution Pool también es no reactivo.
La muestra del donante se clasifica como reactiva cuando el
Resolution Pool es reactivo.
La muestra del donante debe incluirse en otro Resolution Pool cuando el
Resolution Pool no es válido.
Ilustración 1.12
Resolution Pooling
Resolution
Pooling
No reactivo
No válido
Completado,
no reactivo
Completado,
reactivo
Reactivo
Resultado
1.12 02/2007, versión 1.0
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