Roche cobas s 201 system Manual de usuario
- Tipo
- Manual de usuario
02/2008, versión 1.0 1.1
Algoritmos de pooling
1
Información general
El sistema cobas s 201 puede configurarse para crear pooles grandes. Los
pooles grandes contienen alícuotas iguales procedentes de las muestras de
donantes n.
n es igual a 24, 48 ó 96.
Los pooles de gran tamaño se utilizan únicamente para las
pruebas MPX.
Primary Pooling
El proceso de Primary Pooling para pooles grandes consta de dos pasos:
1
Plate Run - Pool
n
(MPX)
: los pooles provisionales con alícuotas procedentes
de 12 muestras de donantes se crean en los pocillos de la placa intermedia.
En la configuración predeterminada, el sistema cobas s 201 prepara una
seroteca para guardar una alícuota procedente de cada tubo de donante,
por si se necesitara en un análisis secundario.
2 Batch Run - Pool n (MPX): se pipetean los controles y, a continuación, se
combinan alícuotas iguales procedentes de los pocillos de la placa
intermedia en tubos S para crear pooles de 24 (dos pocillos), 48 (cuatro
pocillos) o 96 (ocho pocillos) muestras.
Secondary Pooling
Si los resultados de la prueba en un Primary Pool de gran volumen no son
válidos o son reactivos, será necesario realizar seguidamente un análisis
(secundario). La modalidad Secondary Pooling incluye las siguientes
opciones:
• Repeat Batch Run - Pool n (MPX): el paso 2 de la serie analítica
Primary Pooling se repite para volver a analizar las muestras de
donantes con resultados no válidos.
• Pooling de dos dimensiones (2D) (MPX): consiste en crear una
matriz de pooles de donantes, en la que se pipetea cada muestra de
donante en un grupo único formado por dos pooles separados de
modo que, si dos pooles son reactivos, los resultados podrán
atribuirse a una determinada muestra de donante.
• Confirmation Pooling (MPX): consiste en crear pooles de una sola
muestra para confirmar si las muestras de donantes sospechosas
son reactivas. Las muestras restantes se agrupan en pooles de
cuatro, seis, once o doce muestras para confirmar que los
resultados de la prueba no son reactivos.
1.2 02/2008, versión 1.0
• Resolution Pooling (MPX): consiste en preparar los pooles de una
sola muestra para analizar individualmente muestras de pooles no
válidos o reactivos.
Ruta del flujo de trabajo
A continuación, se muestra la ruta del flujo de trabajo predeterminada
para analizar las muestras en pooles de gran tamaño (ilustración 1.1).
Ilustración 1.1
Ruta del flujo de trabajo para pooles de gran tamaño
Error
No reactivo
Reactivo
OK
Resultado
Estado del
pipeteo
No
Sí
Primary Pools de
24, 48 ó 96
(serie analítica
de batch)
Repeat Batch
Run
Complete,
Non-Reactive
OK
Aspirado
Error
Estado del
pipeteo
No válido
Primary Pools de
24, 48 ó 96
(serie analítica
de placas)
Pool escaso
Confirmation
Pooling
No
No válido
Complete,
Non-Reactive
No reactivo
Resultado
Complete,
Non-Reactive
Complete,
Reactive
Reactivo
Tamaño del
pool
Igual a 1
Sí
Excluye los
donantes con
prueba positiva
externa
Superior a 1
Resolution
Pooling
No reactivo
No válido
Complete,
Non-Reactive
Complete,
Reactive
Reactivo
Resultado
Otros
2D Pooling
No reactivo
Batch no válid
o
Evaluación
matriz 2D
Algoritmos de pooling
02/2008, versión 1.0 1.3
El sistema se encarga de asignar las rutas de la ilustración 1.1. El
administrador del laboratorio puede cambiar la ruta del flujo de
trabajo predeterminada y utilizar, por ejemplo, un Resolution
Pooling para volver a analizar las muestras procedentes de pooles
reactivos o no válidos (consulte el apartado Cambiar la petición de
pooling en el Manual de referencia de hardware y software del sistema
cobas s 201).
Serie analítica de placas
La serie analítica de placas es el primer paso de un proceso de Primary
Pooling. Las muestras que se pipetean correctamente en la placa
intermedia durante la serie analítica de placas se programan para una serie
analítica de batch, que es el segundo paso de un proceso de Primary
Pooling.
Si se han aspirado correctamente, las muestras con errores de pipeteo se
programan para la modalidad Resolution Pooling (ilustración 1.19). De
lo contrario, podrán incluirse en otra serie analítica de placas
(ilustración 1.2).
Ilustración 1.2
Serie analítica de placas
Resolution
Pooling
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de placas)
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de batch)
No
Sí
Aspirado
Error
OK
Estado del
pipeteo
1.4 02/2008, versión 1.0
Serie analítica de batch
La serie analítica de batch es el segundo paso de un proceso de Primary
Pooling. Las muestras que se pipetean correctamente en un pool de gran
tamaño durante la serie analítica de batch se analizan para detectar la
presencia de los analitos buscados (ilustración 1.3).
• Las muestras de donantes del pool se clasifican como no-reactivas
cuando el pool es no reactivo.
• Si el pool es reactivo y contiene las 96, 48 ó 24 muestras previstas,
las muestras de donantes del pool se programan para la modalidad
2D Pooling (ilustración 1.4).
• Si el pool es reactivo pero contiene menos de las 96, 48 ó 24
muestras previstas (a causa de errores de pipeteo), las muestras de
donantes del pool escaso se programan para la modalidad
Confirmation Pooling (ilustración 1.18).
• Si el resultado de la prueba no es válido, se programará otra serie
analítica de batch (Repeat Batch Run).
Las muestras con errores de pipeteo se incluirán en un Resolution Pooling.
Ilustración 1.3
Serie analítica de batch
Resolution
Pooling
Error
No reactivo
Reactivo
OK
No válido
Resultado
Estado del
pipeteo
Pool escaso
No
Sí
Primary Pools
de 24, 48 ó 96
(serie analítica
de batch)
2D Pooling
Repeat
Batch Run
Confirmation
Pooling
Complete,
Non-Reactive
Algoritmos de pooling
02/2008, versión 1.0 1.5
2D Pooling
Si el resultado un Primary Pool o Repeat Batch Pool es reactivo y el pool
contiene todo el complemento (24, 48 ó 96) de las muestras de donantes,
se programará la modalidad 2D Pooling.
El administrador del laboratorio puede utilizar la modalidad 2D
Pooling en vez de una Repeat Batch Run para volver a analizar un
Primary Pool no válido.
La modalidad 2D Pooling crea una matriz de pooles de muestras, en la que
cada muestra de donante del pool original se pipetea en un grupo único
formado por dos pooles separados. Los resultados de los dos pooles se
evalúan para determinar si la muestra de donante es no reactiva o si es
preciso realizar un Resolution Pooling (ilustración 1.4).
El número de pooles de la matriz 2D depende del tamaño del Primary
Pool inicial:
Ilustración 1.4
2D Pooling
2D Pooling
Batch no válido
Evaluación
matriz 2D
Resolution
Pooling
Complete,
Non-Reactive
No reactivo
Otros
Tamaño del
Primary Pool
Número de pooles en 2D MxN
24 4 pooles de 6 muestras
6 pooles de 4 muestras
4x6
48 8 pooles de 6 muestras
6 pooles de 8 muestras
8x6
96 Dos batches que contienen
cada uno:
8 pooles de 6 muestras
6 pooles de 8 muestras
8x6
(dos matrices)
1.6 02/2008, versión 1.0
Evaluación de la matriz 2D
La evaluación de la matriz de pooles en 2D MxN se basa en el examen de
los resultados horizontales del pool P
H
(M), los resultados verticales del
pool P
V
(N) y la interpretación de los resultados del donante en la
intersección (R
h,
R
v
).
Los diagramas de las páginas siguientes muestran los diferentes escenarios
que puede presentar una matriz de la modalidad 2D Pooling. Los círculos
(situados fuera de la matriz) contienen los resultados de la prueba con el
pool (tubo S). Los cuadrados (en el interior de la matriz) son los
resultados del donante que se interpretan a partir de los resultados de la
prueba correspondientes a los dos pooles en los que se realiza la prueba
con la muestra del donante.
En todos los ejemplos se utiliza una matriz de 6x4.
Ilustración 1.5
Información general para la evaluación de 2D Pooling
Resultado horizontal
Resultado vertical
La intersección representa
una muestra de donante
Algoritmos de pooling
02/2008, versión 1.0 1.7
Ejemplo 1
Todos los resultados de las pruebas con los pooles en 2D son no reactivos
(-). Todas las intersecciones (-,-) se interpretan como no reactivas. Todas
las muestras de donante se marcan como Complete, Non-Reactive
(ilustración 1.6).
Ejemplo 2
Uno de los resultados horizontales y uno de los resultados verticales de la
prueba con el pool en 2D son reactivos (+). El resto de los resultados de las
pruebas con pooles en 2D, no reactivos (-). La muestra de donante de la
intersección de los pooles reactivos (+,+) se programa para la modalidad
Resolution Pooling. El resto de las intersecciones [(-,-), (+,-), (-,+)] se
interpretan como no reactivas y dichas muestras de donante se marcan
como Complete, Non-Reactive (ilustración 1.7).
Ilustración 1.6
Ejemplo 1 de matriz 2D
Ilustración 1.7
Ejemplo 2 de matriz 2D
Programar para Resolution Pooling
1.8 02/2008, versión 1.0
Ejemplo 3
Uno de los resultados horizontales y uno de los resultados verticales de la
prueba con el pool en 2D son no válidos (I). El resto de los resultados de la
prueba con pooles en 2D, no reactivos (-). La muestra de donante de la
intersección de los pooles no válidos (I,I) se programa para la modalidad
Resolution Pooling. El resto de las intersecciones [(-,-), (I,-), (-,I)] se
interpretan como no reactivas y dichas muestras de donante se marcan
como Complete, Non-Reactive (ilustración 1.8).
Ejemplo 4
Uno de los resultados horizontales de las pruebas en el pool en 2D es
reactivo (+) y uno de los resultados verticales de las pruebas en el pool en
2D es no válido (I) (o viceversa). El resto de los resultados de las pruebas
con pooles en 2D, no reactivos (-). La muestra de donante de la
intersección del pool reactivo y el pool no válido [(+,I) o (I,+)] se
programa para la modalidad Resolution Pooling. El resto de las
intersecciones [(-,-), (+,-), (-,+), (-,I), (I,-)] se interpretan como no
reactivas y dichas muestras de donante se marcan como Complete,
Non-Reactive (ilustración 1.9).
Ilustración 1.8
Ejemplo 3 de matriz 2D
Programar para Resolution Pooling
Ilustración 1.9
Ejemplo 4 de matriz 2D
Programar para
Resolution Pooling
Algoritmos de pooling
02/2008, versión 1.0 1.9
Ejemplo 5
Uno de los resultados horizontales de la prueba con el pool en 2D y dos de
los resultados verticales de la prueba con los pooles en 2D (o viceversa)
son reactivos (+). El resto de los resultados de la prueba con pooles en 2D,
no reactivos (-). Las muestras de donante de las intersecciones (+,+) se
programan para la modalidad Resolution Pooling. El resto de las
intersecciones [(-,-), (+,-), (-,+)] se interpretan como no reactivas y
dichas muestras de donante se marcan como Complete, Non-Reactive
(ilustración 1.10).
Ejemplo 6
Uno de los resultados horizontales y uno de los resultados verticales de la
prueba con el pool en 2D son reactivos (+). Uno de los resultados de las
pruebas con pooles en 2D (en cualquier dirección) es no válido (I). El
resto de los resultados de la prueba con pooles en 2D, no reactivos (-). Las
muestras de donante de las intersecciones [(+,+), (+,I), (I,+)] se
programan
para la modalidad
Resolution Pooling
. El resto de las
intersecciones [(-,-), (+,-), (-+),
(-,I), (I,-)] se interpretan como no
reactivas y dichas muestras de donante se marcan como Complete,
Non-Reactive (ilustración 1.11).
Ilustración 1.10
Ejemplo 5 de matriz 2D
Programar para
Resolution Pooling
Ilustración 1.11
Ejemplo 6 de matriz 2D
Programar para
Resolution Pooling
1.10 02/2008, versión 1.0
Ejemplo 7
Dos de los resultados verticales de las pruebas con los pooles en 2D son
reactivos (+) y uno de los resultados horizontales de las pruebas en el pool
en 2D es no válido (I) (o viceversa). El resto de los resultados de la prueba
con pooles en 2D, no reactivos (-). Las muestras de donante de las
intersecciones [(I,+), (+,I)] se programan para la modalidad Resolution
Pooling. El resto de las intersecciones [(-,-), (-,+), (+,-), (-,I), (I,-)] se
interpretan como no reactivas y dichas muestras de donante se marcan
como Complete, Non-Reactive (ilustración 1.12).
Ejemplo 8
Todos los resultados de las pruebas con pooles en 2D son no válidos (I) o
los ha rechazado el usuario. Toda la parrilla es no válida. Todas las
muestras de donante se programan para (repetición) la modalidad 2D
Pooling (ilustración 1.13).
Los pooles en 2D de repetición sólo están disponibles cuando todos
los pooles en 2D son no válidos.
Ilustración 1.12
Ejemplo 7 de matriz 2D
Programar para
Resolution Pooling
Ilustración 1.13
Ejemplo 8 de matriz 2D
Algoritmos de pooling
02/2008, versión 1.0 1.11
Ejemplo 9
Uno de los resultados horizontales de las pruebas con el pool en 2D es
reactivo (+). No existe ningún resultado reactivo correspondiente
para los
resultados verticales del pool en 2D. El resto de los resultados de la prueba
con pooles en 2D son no reactivos (-).
Las muestras de donante de las
intersecciones (+,-) se programan para la modalidad Resolution Pooling.
El resto de las intersecciones [(-,-) se interpretan como no reactivas y
dichas muestras de donante se marcan como Complete, Non-Reactive
(ilustración 1.14).
Ejemplo 10
Uno de los resultados verticales de las pruebas con el pool en 2D es
reactivo (+). No existe ningún resultado reactivo correspondiente para los
resultados horizontales del pool en 2D. El resto de los resultados de la
prueba con pooles en 2D, no reactivos (-). Las muestras de donante de las
intersecciones (-,+) se programan para la modalidad Resolution Pooling.
El resto de las intersecciones [(-,-) se interpretan como no reactivas y
dichas muestras de donante se marcan como Complete, Non-Reactive
(ilustración 1.15).
Ilustración 1.14
Ejemplo 9 de matriz 2D
Programar para Resolution Pooling
Ilustración 1.15
Ejemplo 10 de matriz 2D
Programar para Resolution Pooling
1.12 02/2008, versión 1.0
Ejemplo 11
Uno de los resultados horizontales de las pruebas con el pool en 2D es no
válido (I). No existe ningún resultado no válido correspondiente para los
resultados verticales del pool en 2D. El resto de los resultados de la prueba
con pooles en 2D, no reactivos (-). Las muestras de donante de las
intersecciones (I,-) se programan para la modalidad Resolution Pooling.
El resto de las intersecciones [(-,-) se interpretan como no reactivas y
dichas muestras de donante se marcan como Complete, Non-Reactive
(ilustración 1.16).
Ejemplo 12
Uno de los resultados verticales de las pruebas con el pool en 2D es no
válido (I). No existe ningún resultado no válido correspondiente para los
resultados horizontales del pool en 2D. El resto de los resultados de la
prueba con pooles en 2D, no reactivos (-). Las muestras de donante de las
intersecciones (-,I) se programan para la modalidad Resolution Pooling.
El resto de las intersecciones [(-,-) se interpretan como no reactivas y
dichas muestras de donante se marcan como Complete, Non-Reactive
(ilustración 1.17).
Ilustración 1.16
Ejemplo 11 de matriz 2D
Programar para Resolution Pooling
Ilustración 1.17
Ejemplo 12 de matriz 2D
Programar para Resolution Pooling
Algoritmos de pooling
02/2008, versión 1.0 1.13
Confirmation Pooling
Cuando un Primary Pool reactivo contiene menos muestras de las
previstas a causa de errores de pipeteo, el sistema programará un
Confirmation Pooling en vez de un 2D Pooling.
Asimismo, el administrador del laboratorio puede utilizar un
Confirmation Pooling en vez de un 2D Pooling. No obstante, una
vez que se haya iniciado la modalidad 2D Pooling, será preciso
seguir el algoritmo de pooling 2D hasta el final.
La modalidad Confirmation Pooling permite analizar algunas muestras
individualmente (p. ej., para confirmar los resultados serológicos
positivos). Las muestras de donantes potencialmente reactivas se
identifican antes de que se inicie el Confirmation Pooling (consulte la
pestaña Exclude Donors en el Manual de referencia de hardware y software
del sistema cobas s 201). Estas muestras se pipetean en pooles de una sola
muestra. Las muestras restantes se pipetean en pooles pequeños. Todos los
pooles se analizan para detectar los analitos buscados (ilustración 1.18).
• La muestra del donante se clasifica como no reactiva cuando un
pool de una sola muestra es no reactivo.
• Las muestras de donantes del pool se clasifican como no-reactivas
cuando un pool con varias muestras es no reactivo.
• La muestra del donante se clasifica como reactiva cuando un pool
de una sola muestra es reactivo.
• Todas las muestras de donantes del pool se programan para la
modalidad Resolution Pooling (ilustración 1.19) cuando un pool
con varias muestras es reactivo.
• Si el resultado de la prueba no es válido, podrá repetirse un
Confirmation Pooling.
Ilustración 1.18
Confirmation Pooling
Resolution
Pooling
Confirmation
Pooling
Complete,
Non-Reactive
No reactivo
Resultado
Complete,
Reactive
Reactivo
Tamaño del
pool
Igual a 1
Excluye los donantes
con prueba positiva
externa
Superior a 1
No válido
1.14 02/2008, versión 1.0
Resolution Pooling
Para las muestras con errores de pipeteo durante la serie analítica Primary
Pooling y muestras de un Confirmation Pool reactivo o 2D Pool reactivo,
se programa la modalidad Resolution Pooling. Cada Resolution Pool
contiene una parte alícuota de una muestra de un donante individual.
Asimismo, el administrador del laboratorio puede utilizar un
Resolution Pooling para solucionar resultados no válidos o reactivos.
Los Resolution Pools se analizan para detectar los analitos buscados
(ilustración 1.19).
• La muestra del donante se clasifica como no reactiva cuando el
Resolution Pool también es no reactivo.
• La muestra del donante se clasifica como reactiva cuando el
Resolution Pool es reactivo.
• La muestra del donante debe incluirse en otro Resolution Pool
cuando el Resolution Pool no es válido.
Ilustración 1.19
Resolution Pooling
Resolution
Pooling
No reactivo
No válido
Complete,
Non-Reactive
Complete,
Reactive
Reactivo
Resultado
-
1
-
2
-
3
-
4
-
5
-
6
-
7
-
8
-
9
-
10
-
11
-
12
-
13
-
14
Roche cobas s 201 system Manual de usuario
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